Skip to main content

Table 5 56 target genes with fold changes>2 in either FF or FFPE

From: Clinical biomarkers of pulmonary carcinoid tumors in never smokers via profiling miRNA and target mRNA

Gene

Bonferroni P-value (FF sample set)

FDR (Q-value) (FF sample set)

Fold change (FF sample set)

Bonferroni P-value (FFPE sample set)

FDR(Q-value) (FFPE sample set)

Fold change (FFPE sample set)

MYT1L

5.51E - 11

3.88E - 12

12.4550

4.53E - 13

1.16E - 13

7.39483

GRIA2

2.45E - 09

4.06E - 11

11.9104

4.43E - 08

2.06E - 09

4.37013

GABRB3

7.34E - 12

1.03E - 12

7.88814

1.21E - 20

6.19E - 21

7.01235

GNG4

1.27E - 10

7.16E - 12

6.99072

0.000262

4.07E - 06

2.79579

BSN

9.94E - 13

2.80E - 13

6.90166

0.32599

0.001558

1.86761

DCX

3.25E - 07

1.99E - 09

6.89053

1

0.004534

2.57829

ADCY1

1.84E - 08

1.86E - 10

6.21244

0.000107

1.96E - 06

4.32350

MAPT

1.65E - 08

1.78E - 10

5.62091

0.006132

5.81E - 05

2.33615

ONECUT2

6.61E - 06

2.43E - 08

5.23250

7.35E - 11

1.25E - 11

9.43872

KIAA1853

6.54E - 07

3.76E - 09

5.19024

0.006683

6.04E - 05

3.04028

KIAA2022

1.54E - 09

2.92E - 11

5.09764

1

0.004154

2.49768

DIO2

1.21E - 06

5.86E - 09

4.70725

4.05E - 08

2.06E - 09

4.34805

MAP1B

5.70E - 09

7.54E - 11

4.63902

6.45E - 05

1.32E - 06

2.70928

LMX1B

4.11E - 06

1.61E - 08

4.52942

4.18E - 09

4.27E - 10

7.73015

GDAP1

4.08E - 10

1.44E - 11

4.48671

4.11E - 08

2.06E - 09

4.16645

PCSK2

2.50E - 05

7.73E - 08

3.86742

0.009937

8.33E - 05

1.89466

KCNMA1

3.23E - 11

3.03E - 12

3.67536

0.031252

0.000228

1.76140

NAPB

0.072657

8.86E - 05

3.46819

0.87771

0.0034

2.01038

LONRF2

1.99E - 10

8.00E - 12

3.44860

0.000555

7.89E - 06

2.72746

BCL11A

6.40E - 10

1.74E - 11

3.44466

0.006028

5.81E - 05

2.17082

NPTXR

1.07E - 06

5.27E - 09

3.30689

1

0.020193

1.94804

CNTNAP2

0.228461

0.000254

3.28905

0.096864

0.000563

3.86958

PPM1E

0.000311

7.63E - 07

3.27730

0.033037

0.000231

4.02684

NRXN1

1.05E - 07

7.43E - 10

3.26422

5.62E - 10

7.18E - 11

3.16390

HOOK1

7.40E - 10

1.74E - 11

3.08291

3.82E - 06

1.08E - 07

2.08999

GRIN3A

0.002214

4.24E - 06

3.05354

0.832186

0.003248

2.27896

ACVR1C

0.000623

1.44E - 06

3.04558

0.226766

0.00116

1.36657

KCNK10

0.001691

3.38E - 06

2.86392

0.024849

0.000194

2.34985

GALNT13

0.063352

7.97E - 05

2.64778

0.032131

0.000228

3.08732

GRIA3

0.005907

9.67E - 06

2.63121

0.006349

5.90E - 05

3.00096

MARK1

2.02E - 07

1.32E - 09

2.61530

0.440426

0.001905

2.17015

NMNAT2

7.98E - 07

4.32E - 09

2.60904

1

0.009004

1.91743

OPRK1

0.034466

4.69E - 05

2.60605

0.360804

0.001688

1.78113

NBEA

0.000203

5.16E - 07

2.54401

0.000695

9.50E - 06

2.06122

PLEKHA6

8.76E - 07

4.66E - 09

2.50270

0.000165

2.78E - 06

2.74812

KIAA0319

0.001813

3.52E - 06

2.47998

0.050027

0.000319

2.93101

LASS6

2.35E - 05

7.36E - 08

2.27989

0.050576

0.000319

2.59056

MRAS

0.154027

0.000179

2.20056

1

0.016486

1.66357

LGI2

2.03E - 05

6.48E - 08

2.19808

1

0.052341

1.27189

PCDHAC1

0.000116

3.05E - 07

2.14330

0.157803

0.000858

2.18946

NCALD

2.54E - 06

1.10E - 08

2.08249

0.047075

0.000305

1.78080

PRKACB

2.67E - 06

1.14E - 08

2.07355

1

0.014795

1.43322

CDC42BPA

1.02E - 05

3.51E - 08

2.05556

0.008406

7.16E - 05

1.85332

ARNT2

0.00032

7.78E - 07

2.05120

1

0.008178

2.51625

ICA1L

6.14E - 06

2.31E - 08

2.04325

0.0004

5.85E - 06

2.04596

GREB1

0.035592

4.82E - 05

1.98638

0.334941

0.001586

2.53911

ARL3

0.004337

7.54E - 06

1.95526

1

0.008061

2.03861

RALGPS1

3.95E - 08

3.28E - 10

1.93623

0.136701

0.000768

2.09949

AGPAT5

0.005877

9.67E - 06

1.75658

0.046976

0.000305

2.40687

CASK

0.00097

2.11E - 06

1.72623

0.364994

0.001688

2.42452

RGS5

0.598115

0.000593

1.57714

0.42732

0.001868

2.13286

PHLPPL

0.037763

5.06E - 05

1.52873

0.66169

0.002643

2.11452

KSR2

0.007235

1.16E - 05

1.52085

1.90E - 08

1.62E - 09

3.17742

ADCY2

0.000858

1.90E - 06

1.38008

0.00176

2.14E - 05

2.87647

  1. Note: If fold changes in the FF or FFPE sample sets are <-2, they are denoted in italics, respectively. If the Bonferroni P-value or FDR (Q-value) are <0.05 or <0.01, they are labeled in bold font, respectively.
  2. FF=Fresh Frozen tissues.
  3. FFPE=Formalin-Fixed Paraffin-Embedded tissues.
  4. FDR=False Discovery Rate.
Back to article page

Cell & Bioscience

ISSN: 2045-3701

Contact us